聚类热图分类注释_complexHeatmap版本的对角线热图

人工智能119

写在前面

这几天看到一直有人在重复这个图,之前看到过base plot的版本,看到过ggplot2的版本。这里就把之前使用complexheatmap绘制的版本也拿来和大家分享一下。

聚类热图分类注释_complexHeatmap版本的对角线热图

主要操作

加载包

注意:ComplexHeatmap包的安装需要安装github版本的。很多函数在bioconductor版本没有。

另外由于complexheatmap在绘制热图的时候,对于颜色的指定是需要用到circlize包的colorRamp2函数,所以需要提前加载。

library(ComplexHeatmap)<br>library(circlize)<br>Sys.setenv(LANGUAGE = "en") #&#x663E;&#x793A;&#x82F1;&#x6587;&#x62A5;&#x9519;&#x4FE1;&#x606F;<br>options(stringsAsFactors = FALSE) #&#x7981;&#x6B62;chr&#x8F6C;&#x6210;factor

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